Conforme descrito na página de desenvolvedores do Facebook no endereço: http://developers.facebook.com/docs/reference/plugins/comments/, o plugin social de comentários possui duas formas de moderação.

Moderação por Administradores

Nesta forma de moderação, os recursos são limitados. Você definirá quantos perfis de administradores desejar, inserindo na meta-tag o ID correspondete a cada um, separado por vírgula sem espaço, dentro da tag da página onde o plugin de comentários do Facebook ficará disponibilizado, conforme abaixo:
<meta property="fb:admins" content="id-do-facebook1"/>
<meta property="fb:admins" content="id-do-facebook2"/>

Substitua as variáveis id-do-facebook1 e  id-do-facebook2 pelos IDs dos respectivos moderadores.

A desvantagem dessa forma é que para incluir ou remover moderadores, será sempre necessário manipular o código-fonte da página.

Descobrindo o ID do perfil do Facebook

Todos os perfis no Facebook possuem um ID único, para descobrir o ID acesse o endereço: http://graph.facebook.com/nome-de-usuário-do-facebook

Substitua no endereço acima a variável nome-de-usuário-do-facebook pelo seu nome de usuário no Facebook, na primeira linha do endereço será exibido seu ID.

Moderação por Aplicativo

Esta forma de moderação é a mais recomendada pelo Facebook, possuindo mais recursos e sendo possível definir todos os moderadores dentro do próprio aplicativo de maneira rápida e fácil.

Uma vez inserido o código meta-tag do aplicativo na página onde o plugin de comentários do Facebook ficará disponibilizado, todos os ajustes, inclusão e remoção de moderadores se dará pelo aplicativo, não sendo mais necessário manipular o código-fonte da página.

Uma vez criado o aplicativo insira o código meta-tag com o ID do aplicativo, dentro da tag da página onde o plugin de comentários do Facebook ficará disponibilizado, conforme abaixo:
<meta property="fb:app_id" content="id-do-aplicativo-do-facebook" />

Substitua a variável id-do-aplicativo-do-facebook pelo ID do seu aplicativo criado para moderar os comentários.

Criando um Aplicativo para Moderar Comentários

Acesse o endereço: http://developers.facebook.com/setup, preencha apenas o campo App Name correspondente ao nome do seu aplicativo, algo como Comentários moderados e clique no botão Criar.

Caso seu perfil já tenha sido verificado através de um número de celular ou cartão de crédito, na página seguinte você preencherá informações como: nome, e-mail, domínio, categoria, etc.

Após concluído este processo, você já terá seu aplicativo criado com o respectivo ID e tendo a opção de adicionar moderadores a ele.

Configurando um Aplicativo para Moderar Comentários

Após criado e integrado o aplicativo ao seu site, para moderar os comentários do Facebook acesse o endereço: http://developers.facebook.com/tools/comments, aparecerá a página Comment Moderation Tool ou em português Ferramenta de Moderação de Comentários.

Caso você queira editar a configuração de comentários, clique em Configurações. Na página seguinte:

Nela você pode incluir moderadores, palavras na lista negra ou definir o modo de moderação, dentre outras funções. No modo de moderação, existem duas opções:

Make every post public by default – O comentário vai direto para o site mas pode ser ocultado depois, caso você julgue necessário.

Let me approve each comment before it appears – O comentário só aparecerá no site após a sua aprovação. Para moderar um comentário, clique em Visualização do moderador, selecione o comentário e escolha dentre as opções ocultar comentário, banir usuário e comentário popular.