O comando de cópia no SSH corresponde a:
cp

Este comando em algumas distribuições do Linux é alias, um atalho para:
cp -i

Não importa que você tente forçar o comando:
cp -f

Ele será sempre interativo, porque o alias está configurado por padrão, tal qual:
ll

Que corresponde a um alias de:
ls -l

Para copiar grande quantidade de arquivos através de SSH que você tenha que sobrepô-los e não deseja confirmar um por um, realize o comando abaixo:
/bin/cp -rf