Por padrão o Apache vem com a diretiva global directory habilitada para exibir toda a estrutura de diretórios e arquivos quando não há uma página de índice em qualquer diretório.

Esta medida pode não ser muito segurança na medida que qualquer usuário tem acesso aos seus sub-diretórios, nomes de diretórios, nomes de arquivos, respectivas extensões, podem baixar arquivos internos que não esteja público, etc.

Para desabilitar esta diretiva global proibindo a exibição da estrutura, siga o caminho: Web Host Manager > Service Configuration > Apache Configuration > Global Configuration > Directory “/” > Indexes, desmarque esta opção.

Caso deseje listar a estrutura de diretórios e arquivos de um determinado diretório passando por cima da diretiva global do Apache até então modificada por você, siga o caminho: painel de controle cPanel > Gerenciador de Index, clique no diretório desejado e escolha entre as opções: Index Standard (somente texto) ou Fancying Indexing (gráficos e texto).